揭秘ROX:有了Ta,实验结果稳了!


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师兄,我要emo了,这次的实验数据很不理想。



别着急,你和我详细说说。




数据的重复性不好,扩增曲线也杂乱无章



是不是没有使用ROX校正呀?我们实验室里的qPCR仪是需要ROX校正的。








还需要设置ROX校正?师兄,你快教教我!








那我们一起来学习一下吧!



GO






什 么 是 ROX ?



ROX是一种惰性参比染料,能被qPCR仪检测到,但在PCR反应过程中,ROX的荧光信号不随扩增而改变,始终保持在一个稳定的水平上,不会对qPCR反应产生影响。

实验过程中有很多因素会引起孔间差异,比如:反应体系浓度、仪器的物理特性、移液操作以及耗材质量等,因此,可以将ROX作为阳性参比,对其他荧光信号进行归一化校正,从而提高数据的精确度。





使用ROX需要注意什么?



1.确保反应体系中ROX浓度与所用qPCR仪器的要求相匹配。

2.在设计实验时,不应选择与ROX波长重叠的荧光基团,以避免ROX与荧光探针发生干扰。

3.在购买MIX型试剂时,要确认试剂中是否已含ROX,避免重复添加。

4.PCR软件通常会默认使用ROX并进行归一化计算,若试剂本身不含ROX或者实验不需要进行ROX校正,就需要修改软件设置,将被动参考选项改为无,以避免发生错误。

5.在qPCR实验中,ROX的加入应保证在所有样品和反应体系中保持一致,确保实验的稳定性和重复性。





如何避免BadRox报错?



BadRox报错通常是指在荧光定量PCR过程中ROX浓度与仪器机型不匹配(过高或过低)导致的荧光强度差异,从而影响实验结果的准确性。

由于光学激发系统的差异,qPCR仪器对ROX染料浓度的需求也不同,目前市售的qPCR设备大致可以分为三类:不需要ROX校正的、需要高浓度ROX校正的以及需要低浓度ROX校正的。

因此,为避免BadRox报错,要提前了解设备对ROX浓度的需求,配制对应浓度的反应液;若选择qPCR预混试剂,应注意使用与仪器相兼容的预混液,确保其ROX浓度符合要求。若出现BadRox报错问题,先不用急着重复实验,可以在仪器设置中取消ROX的校正功能,若扩增曲线恢复正常且数据的重复性好,则数据还可以用。













正确选择ROX浓度是确保qPCR实验成功的重要步骤。面对市场上众多不同要求的qPCR设备,使用时必须要匹配合适的ROX参比染料的浓度,这不仅增加了实验的复杂性,也很容易让实验出错。要是有通用于所有qPCR仪的定量产品就好了!



好 物 推 


实验不用愁 小优来解忧


操作无烦恼



优基生物现畅销的qPCR试剂(ROX通用款):uGreener Flex qPCR 2X Mix (ROX plus)uGreener Fast qPCR 2X Mix (ROX plus) ,制品中含有能兼容所有qPCR仪的ROX Reference Dye,无需在不同仪器上调整ROX的浓度。制品均为2X预混液型,使用方便!



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此外,基于抗体修饰的热启动Taq DNA polymerase、dNTP、特别优化的buffer以及特殊的PCR促进因子和改良的嵌合荧光染料,制品具有特异性强检测感度高荧光信号强等特点,能适用于各种长度、GC含量、二级结构目标产物的荧光定量PCR反应,且可以在宽广的定量区域内得到良好的标准曲线;uGreener Fast qPCR 2X Mix (ROX plus)还能够兼容快速反应程序,在300bp以内的扩增产物可设定10s延伸的快速程序,缩短反应时间的同时保证荧光强度!


好物推荐

产品信息


货号产品名称规格
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qPCR 2X Mix 

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500 rxns

(20 μl/rxn)

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